Die Orgel der Pfarrkirche St. Pankratius in Emmering wurde 1972 von der Orgelbaufirma Staller aus Grafing gebaut. Von der gleichen Firma stammt in unserem Pfarrverband noch die Orgel in der Filialkirche Lorenzenberg. Vorgänger des aktuellen Instruments war eine einmanualige Orgel mit 14 Registern des Rosenheimer Orgelbaumeisters Franz Seraphim Koroschak aus dem Jahre 1883. Die erste bekannte Orgel in Emmering war eine einmanualige Orgel von Andreas Grünerdt aus München aus dem Jahre 1796.
Der Orgelprospekt ist klar in die einzelnen Werke der Orgel getrennt. Oben in der Mitte findet man die Pfeifen des Hauptwerks mit den Pfeifen des Prinzipals 8‘ im Prospekt. Unterhalb des Hauptwerks befindet sich das schwellbare Brustwerk. Die Manualwerke werden zu beiden Seiten flankiert von den Pfeifen des Pedals mit dem Oktavbass 8‘ im Prospekt. Der Spieltisch befindet sich freistehend auf der Empore mit Blick in Richtung Orgel.
Die Windversorgung erfolgt über ein elektrisches Gebläse, das sich schallgedämmt außerhalb der Empore im Treppenhaus zu dieser befindet. Die weitere Windversorgung befindet sich unterhalb des Hauptwerks im Orgelgehäuse.
Die Registertraktur ist als mechanische Schleifladen gebaut. Die Tontraktur ist ebenso wie die Koppeln mechanisch gebaut. Die Mechanik arbeitet (Stand 2017) problemlos, lediglich der Anschlag bei gekoppelten Manualen ist etwas schwergängig.
Der Tonumfang beträgt in den Manualen C bis g‘‘‘ und im Pedal C bis f‘.